# 生物信息

PyMOL-MCP是一个通过Model Context Protocol (MCP)将PyMOL与Claude AI集成的工具，实现通过自然语言控制分子可视化和结构分析。

UniProt MCP服务器是一个提供蛋白质信息查询的服务，支持通过UniProt编号获取蛋白质名称、功能描述、序列等信息，并支持批量查询和缓存功能。

为生物信息学家和计算生物学家提供的MCP服务器

UniProt MCP服务器是一个为语言模型提供蛋白质信息查询的服务，支持从UniProt数据库搜索蛋白质、获取详细信息、序列、功能注释和结构数据，可集成到Claude Desktop等AI应用中。

一个基于Model Context Protocol (MCP)的UniProt蛋白质信息查询服务器，提供蛋白质功能、序列等信息的获取服务，支持单条和批量查询，具有缓存和错误处理功能。

AlphaFold MCP服务器提供对AlphaFold蛋白质结构数据库的全面访问，包含结构检索、置信度分析、批量处理和可视化准备等丰富工具。

非官方的STRING数据库MCP服务器，提供蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析和比较基因组学工具，支持通过STRING API访问全面的蛋白质数据。

OpenGenes-MCP是一个基于Model Context Protocol (MCP)的服务器，为OpenGenes数据库提供标准化接口，用于访问衰老和长寿研究数据。该服务器自动从Hugging Face Hub下载最新的OpenGenes数据库，确保用户始终能获取最新数据。数据库包含寿命变化实验数据、基因分类标准、衰老标志关联和长寿关联研究等内容，支持通过自然语言查询转换为SQL查询，方便研究人员和AI助手使用。

SAMtools MCP为SAM/BAM/CRAM文件提供标准化操作接口，支持格式转换、排序、统计等核心功能。

该项目是基于Broad研究所Liftover工具的MCP服务接口，提供基因组坐标转换功能，支持单点、区间、变异和HGVS格式的转换。

该项目是一个提供GWAS Catalog REST API程序化接口的MCP服务器，支持访问GWAS研究、变异、性状和关联数据，并自动处理大规模结果集。

一个实验性的nf-core工具MCP项目，提供创建管道、模块管理等功能

AlphaFold MCP服务器是一个提供蛋白质结构预测分析工具的综合平台，支持结构检索、质量评估、批量处理和可视化集成等功能。

Bio-OS MCP Server是一个基于模型上下文协议的工具和提示服务器，为Bio-OS提供工作流管理和Docker镜像构建功能，支持本地和云端两种部署方式。

UniProt MCP服务器是一个提供蛋白质信息查询的服务，支持通过UniProt编号获取蛋白质功能和序列信息。

Scanpy MCP是一个为单细胞RNA测序分析软件Scanpy设计的自然语言处理服务器，支持通过自然语言进行数据读写、预处理、分析和可视化等操作，适用于研究人员和代理开发者。

非官方的UniProt MCP服务器，提供26种生物信息学工具，支持蛋白质搜索、结构分析、功能注释等高级功能，通过REST API直接访问UniProt数据库。

非官方的基因本体MCP服务器，提供基因本体(GO)数据的全面访问，支持AI系统进行基于本体的分析、基因注释研究和功能富集研究。

非官方的STRING数据库MCP服务器，提供蛋白质相互作用网络分析、功能富集和比较基因组学工具，支持通过STRING API进行全面的蛋白质网络研究。