MCP Nf Core
M

MCP Nf Core

一个实验性的nf-core工具MCP项目,提供创建管道、模块管理等功能
2分
5.3K

什么是Nf-core Tools MCP Server?

这是一个基于Model Context Protocol (MCP)的实验性服务器,专门为nf-core工具提供接口服务。它允许用户通过标准化的协议访问nf-core的功能,包括创建分析流程、管理模块等。

如何使用Nf-core Tools MCP Server?

您可以通过Claude桌面应用或Cursor编辑器连接到此MCP服务器。安装配置后,即可通过标准接口调用nf-core工具的各种功能。

适用场景

适用于生物信息学研究人员和数据分析师,特别是那些使用nf-core框架构建标准化分析流程的用户。

主要功能

创建分析流程
使用nf-core模板创建新的生物信息学分析流程
列出模块
查看所有可用的nf-core模块
创建模块
使用nf-core模块模板创建新的分析模块
安装模块
将现有的nf-core模块安装到您的流程或模块仓库中
优势
提供标准化的接口访问nf-core工具功能
支持两种实现方式(CLI和Python包)
易于集成到现有工作流中
简化了nf-core工具的使用流程
局限性
目前是实验性实现,功能可能不稳定
需要预先安装nf-core工具和相关依赖
对非技术用户可能有学习曲线

如何使用

创建虚拟环境
使用uv工具创建一个Python虚拟环境
激活环境
激活新创建的虚拟环境
安装依赖
安装所需的Python包
安装服务器
选择并安装适合您需求的服务器实现

使用案例

创建新分析流程
使用MCP服务器通过nf-core模板创建新的生物信息学分析流程
安装现有模块
将现有的nf-core模块安装到您的项目中

常见问题

CLI和Python两种实现方式有什么区别?
我需要预先安装哪些软件?
这个MCP服务器支持哪些nf-core功能?

相关资源

Claude桌面应用
连接MCP服务器所需的客户端应用
uv包管理器
快速Python包管理工具
nf-core工具
nf-core官方工具库

安装

复制以下命令到你的Client进行配置
注意:您的密钥属于敏感信息,请勿与任何人分享。

替代品

C
Contracts Wizard
OpenZeppelin Contracts Wizard是一个交互式智能合约构建工具,允许用户通过选择合约类型、参数和功能来生成基于OpenZeppelin组件的合约代码。支持多种编程语言,并提供API和嵌入功能。
TypeScript
5.9K
4分
A
Apple Health MCP
一个用于通过SQL查询苹果健康数据的MCP服务器,基于DuckDB实现高效分析,支持自然语言查询和自动报告生成。
TypeScript
9.2K
4.5分
Z
Zen MCP Server
Zen MCP是一个多模型AI协作开发服务器,为Claude和Gemini CLI等AI编码助手提供增强的工作流工具和跨模型上下文管理。它支持多种AI模型的无缝协作,实现代码审查、调试、重构等开发任务,并能保持对话上下文在不同工作流间的延续。
Python
13.9K
5分
C
Container Use
Container Use是一个开源工具,为编码代理提供容器化隔离环境,支持多代理并行开发且互不干扰。
Go
9.6K
5分
S
Search1api
Search1API MCP Server是一个基于Model Context Protocol (MCP)的服务器,提供搜索和爬取功能,支持多种搜索服务和工具。
TypeScript
18.5K
4分
D
Duckduckgo MCP Server
已认证
DuckDuckGo搜索MCP服务器,为Claude等LLM提供网页搜索和内容抓取服务
Python
38.9K
4.3分
M
MCP Server Airbnb
已认证
Airbnb房源搜索与详情查询的MCP服务
TypeScript
15.0K
4分
M
MCP Alchemy
已认证
MCP Alchemy是一个连接Claude Desktop与多种数据库的工具,支持SQL查询、数据库结构分析和数据报告生成。
Python
17.8K
4.2分
F
Figma Context MCP
Framelink Figma MCP Server是一个为AI编程工具(如Cursor)提供Figma设计数据访问的服务器,通过简化Figma API响应,帮助AI更准确地实现设计到代码的一键转换。
TypeScript
43.2K
4.5分
F
Firecrawl MCP Server
Firecrawl MCP Server是一个集成Firecrawl网页抓取能力的模型上下文协议服务器,提供丰富的网页抓取、搜索和内容提取功能。
TypeScript
64.5K
5分
D
Duckduckgo MCP Server
已认证
DuckDuckGo搜索MCP服务器,为Claude等LLM提供网页搜索和内容抓取服务
Python
38.9K
4.3分
E
Exa Web Search
已认证
Exa MCP Server是一个为AI助手(如Claude)提供网络搜索功能的服务器,通过Exa AI搜索API实现实时、安全的网络信息获取。
TypeScript
31.6K
5分
B
Baidu Map
已认证
百度地图MCP Server是国内首个兼容MCP协议的地图服务,提供地理编码、路线规划等10个标准化API接口,支持Python和Typescript快速接入,赋能智能体实现地图相关功能。
Python
32.1K
4.5分
M
Minimax MCP Server
MiniMax Model Context Protocol (MCP) 是一个官方服务器,支持与强大的文本转语音、视频/图像生成API交互,适用于多种客户端工具如Claude Desktop、Cursor等。
Python
35.7K
4.8分
C
Context7
Context7 MCP是一个为AI编程助手提供实时、版本特定文档和代码示例的服务,通过Model Context Protocol直接集成到提示中,解决LLM使用过时信息的问题。
TypeScript
47.3K
4.7分
E
Edgeone Pages MCP Server
EdgeOne Pages MCP是一个通过MCP协议快速部署HTML内容到EdgeOne Pages并获取公开URL的服务
TypeScript
19.7K
4.8分
AIbase
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