MedixHub模型上下文协议（MCP）服务器

一个带有MedixHub集成医疗和医疗保健API访问的Model Context Protocol (MCP)服务器。

功能

• 纯JavaScript实现
• 暴露具有标准化MCP元数据的功能
• 执行带参数验证的功能
• 与Ollama等大型语言模型无缝集成
• 带有安全API端点的身份验证
• 支持流式响应

实现的功能

该服务器包含JavaScript实现的以下功能：

1. executeOpenTargetQuery - 对OpenTarget API执行GraphQL查询
2. FDADrugLabelSearch - 从FDA数据库检索药物信息
3. get_drug_generic_name - 在通用名和品牌名之间映射药物名称
4. MonarchSearch - 搜索Monarch数据库中的基因、疾病或表型
5. MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes - 找到与多个表型匹配的疾病

OpenTarget功能

• 疾病信息查询
• 药物细节和关联
• 目标（基因/蛋白质）信息
• 疾病-目标关联
• 药物-疾病关系

FDA药物标签功能

• 药物信息搜索
• 通用名和品牌名映射
• 不良反应查询
• 药物相互作用搜索

Monarch数据库功能

• 生物医学实体搜索
• 疾病-表型关联
• 基因-表型关系
• 多表型疾病查找

入门指南

先决条件

• Node.js 14或更高版本
• npm或yarn

安装

1. 克隆仓库

git clone https://github.com/yourusername/medixhub-mcp-server.git
cd medixhub-mcp-server

2. 安装依赖项

npm install

3. 配置环境变量

cp .env.example .env
# 编辑.env文件以设置您的配置

4. 启动服务器

npm start

用于开发的自动重载：

npm run dev

使用方法

执行API

使用/execute端点运行任何已注册的MedixHub功能：

POST /execute
Content-Type: application/json

{
  "name": "queryFDADrugLabel",
  "parameters": {
    "searchFields": {
      "drug_name": ["openfda.brand_name", "openfda.generic_name"]
    },
    "返回值": [
      "generic_name",
      "brand_name"
    ]
  }
}

功能

• executeOpenTargetQuery: 对OpenTarget API执行GraphQL查询以获取药物信息。
• FDADrugLabelSearch: 搜索FDA数据库中的药物标签信息。
• get_drug_generic_name: 根据品牌名称查找通用药物名称。
• MonarchSearch: 在Monarch知识库中搜索基因、疾病或表型。
• MonarchDiseasesForMultiplePhenotypes: 找到与多个表型相关的疾病。

开发

项目结构

medixhub-mcp-server/
├── server.js          # 主服务器文件
├── routes/           # API路由定义
│   ├── openTargetRoutes.js       # OpenTarget相关路由
│   └── monarchRoutes.js         # Monarch相关路由
├── controllers/      # 控制器逻辑
│   ├── openTargetController.js  # OpenTarget控制器
│   └── monarchController.js     # Monarch控制器
└── .env.example       # 环境变量示例文件

性能考虑

• 所有API调用都使用异步处理
• 启用了速率限制以防止滥用
• 超时处理可防止请求挂起
• 内存使用经过优化，以高效处理流

许可证

该项目根据MIT许可证发布 - 有关详细信息，请参阅LICENSE文件。