Primekg MCP
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Primekg MCP

将精准医学知识图谱(PrimeKG)导入Neo4j数据库的项目,用于生物医学数据分析和探索。
2分
5.4K

什么是PrimeKG to Neo4j?

这是一个将Precision Medicine Knowledge Graph (PrimeKG)数据导入Neo4j图形数据库的项目。PrimeKG整合了20个高质量生物医学资源,描述了17,080种疾病和超过400万种关系。

如何使用PrimeKG to Neo4j?

项目提供完整的处理流程:1)下载并处理PrimeKG数据 2)导入Neo4j数据库 3)提供查询分析工具

适用场景

适用于生物医学研究人员、药物开发人员和数据科学家进行疾病关联分析、药物发现和精准医学研究

主要功能

多源数据整合
整合20个高质量生物医学资源,实现跨资源数据关联
图形化展示
通过Neo4j提供直观的图形界面展示疾病、基因、药物等实体间复杂关系
灵活查询分析
支持Cypher查询语言,可执行复杂的关系路径分析和模式匹配
优势
整合多个权威生物医学数据库,数据质量高
图形数据库结构适合展示复杂生物网络关系
提供标准化的数据导入流程和查询接口
局限性
需要基本的Neo4j和Cypher知识才能充分利用
数据量大,需要足够的存储和计算资源
定期更新需要重新导入完整数据集

如何使用

准备环境
安装Docker和Neo4j数据库(推荐4.4或更高版本)
下载PrimeKG数据
从项目网站下载最新PrimeKG数据集
数据预处理
运行预处理脚本准备导入数据
导入Neo4j
使用提供的导入工具将处理后的数据导入Neo4j

使用案例

疾病-药物关联分析
探索特定疾病相关的所有药物及其作用机制
多跳关系路径发现
发现疾病通过基因、通路等中间实体与其他疾病的潜在关联

常见问题

需要多少存储空间来存储PrimeKG数据?
数据更新频率如何?
没有Neo4j经验可以使用这个项目吗?

相关资源

PrimeKG官方网站
PrimeKG项目的官方网站,包含数据下载和文档
Neo4j学习中心
Neo4j官方学习资源,包含Cypher语言教程
项目GitHub仓库
本项目的源代码和问题追踪

安装

复制以下命令到你的Client进行配置
注意:您的密钥属于敏感信息,请勿与任何人分享。

替代品

A
Apple Health MCP
一个用于通过SQL查询苹果健康数据的MCP服务器,基于DuckDB实现高效分析,支持自然语言查询和自动报告生成。
TypeScript
9.2K
4.5分
M
MCP Server Airbnb
已认证
Airbnb房源搜索与详情查询的MCP服务
TypeScript
15.0K
4分
M
MCP Alchemy
已认证
MCP Alchemy是一个连接Claude Desktop与多种数据库的工具,支持SQL查询、数据库结构分析和数据报告生成。
Python
17.9K
4.2分
P
Postgresql MCP
一个基于FastMCP库的PostgreSQL数据库MCP服务,提供对指定表的CRUD操作、模式检查和自定义SQL查询功能。
Python
14.2K
4分
A
Awesome MCP List
这是一个持续更新的MCP服务器精选列表,涵盖了浏览器控制、艺术与文化、云平台、命令行、通信、客户数据平台、数据库、开发者工具、数据科学工具、文件系统、金融与金融科技、游戏、知识与记忆、位置服务、营销、监控、搜索和实用工具等多个类别。每个项目都附带了GitHub链接和星标数量,方便用户快速了解和使用。
10.1K
5分
W
Wren
Wren Engine是一个为MCP客户端和AI代理设计的语义引擎,提供语义层支持,使AI能准确理解企业数据模型和业务逻辑。它支持多种数据源,嵌入MCP客户端,确保数据交互的精确性和治理。
Java
12.3K
4分
M
MCP Redis
已认证
Redis MCP Server是一个为Redis设计的自然语言接口服务,支持AI代理通过自然语言查询和管理Redis数据,集成MCP协议,提供多种数据结构和搜索功能。
Python
9.6K
4.5分
S
Supabase MCP Server
Supabase MCP服务器是一个开源工具,允许IDE安全执行SQL、管理模式变更、调用Supabase管理API和使用Auth Admin SDK,内置安全控制。
Python
16.1K
5分
F
Firecrawl MCP Server
Firecrawl MCP Server是一个集成Firecrawl网页抓取能力的模型上下文协议服务器,提供丰富的网页抓取、搜索和内容提取功能。
TypeScript
64.7K
5分
D
Duckduckgo MCP Server
已认证
DuckDuckGo搜索MCP服务器,为Claude等LLM提供网页搜索和内容抓取服务
Python
39.0K
4.3分
F
Figma Context MCP
Framelink Figma MCP Server是一个为AI编程工具(如Cursor)提供Figma设计数据访问的服务器,通过简化Figma API响应,帮助AI更准确地实现设计到代码的一键转换。
TypeScript
43.3K
4.5分
E
Edgeone Pages MCP Server
EdgeOne Pages MCP是一个通过MCP协议快速部署HTML内容到EdgeOne Pages并获取公开URL的服务
TypeScript
20.7K
4.8分
M
Minimax MCP Server
MiniMax Model Context Protocol (MCP) 是一个官方服务器,支持与强大的文本转语音、视频/图像生成API交互,适用于多种客户端工具如Claude Desktop、Cursor等。
Python
36.2K
4.8分
E
Exa Web Search
已认证
Exa MCP Server是一个为AI助手(如Claude)提供网络搜索功能的服务器,通过Exa AI搜索API实现实时、安全的网络信息获取。
TypeScript
31.7K
5分
C
Context7
Context7 MCP是一个为AI编程助手提供实时、版本特定文档和代码示例的服务,通过Model Context Protocol直接集成到提示中,解决LLM使用过时信息的问题。
TypeScript
47.7K
4.7分
B
Baidu Map
已认证
百度地图MCP Server是国内首个兼容MCP协议的地图服务,提供地理编码、路线规划等10个标准化API接口,支持Python和Typescript快速接入,赋能智能体实现地图相关功能。
Python
32.2K
4.5分
AIbase
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