MCP Atomictoolkit

MCP Atomictoolkit

一个兼容MCP协议的服务器项目，通过ASE、pymatgen和机器学习原子间势能（MLIPs）提供原子尺度模拟功能，目前正在积极开发中。

研究与数据开发者工具 #原子模拟 #MCP协议 #机器学习 #结构优化 .Python

评分 : 2.5分

下载量 : 14

更新时间 : 2025-04-29

什么是Atomistic Toolkit MCP Server?

这是一个基于ASE(原子模拟环境)和pymatgen的工具服务器，提供原子级材料模拟功能。它允许用户创建和操作分子结构，进行几何优化，并支持多种文件格式的读写操作。

如何使用Atomistic Toolkit MCP Server?

通过MCP协议与服务器建立连接后，您可以发送结构创建请求、优化指令或文件操作命令。服务器会返回计算结果或处理后的结构数据。

适用场景

适用于材料科学研究、分子动力学模拟、晶体结构分析等领域。特别适合需要原子级精度计算的研究人员。

主要功能

结构创建与操作支持创建各种分子和晶体结构，并提供原子位置调整、晶格参数修改等功能

几何优化对分子或晶体结构进行能量最小化计算，找到最稳定的构型

文件I/O操作支持多种格式的结构文件读写，包括CIF、POSCAR、XYZ等常见格式

优势与局限性

优势

集成多种原子模拟工具(ASE, pymatgen)

支持机器学习原子间势(MLIPs)

通过标准MCP协议易于集成

局限性

项目仍在积极开发中，部分功能可能不稳定

需要一定的计算资源支持

对非专业用户学习曲线较陡

如何使用

建立连接

通过MCP协议与服务器建立连接

发送请求

发送结构创建或计算请求

获取结果

接收并处理服务器返回的计算结果

使用案例

创建硅晶体结构创建一个金刚石结构的硅晶体，并进行几何优化

分子结构优化对有机分子进行结构优化，寻找最低能量构型

常见问题

这个服务器支持哪些文件格式?

计算需要多长时间?

如何知道哪些功能已经可用?

相关资源

ASE文档

原子模拟环境(ASE)官方文档

pymatgen文档

pymatgen材料分析库文档

MCP协议说明

Model Context Protocol官方说明

精选MCP服务推荐

Duckduckgo MCP Server

DuckDuckGo搜索MCP服务器，为Claude等LLM提供网页搜索和内容抓取服务

Firecrawl MCP Server

Firecrawl MCP Server是一个集成Firecrawl网页抓取能力的模型上下文协议服务器，提供丰富的网页抓取、搜索和内容提取功能。

Figma Context MCP

Framelink Figma MCP Server是一个为AI编程工具（如Cursor）提供Figma设计数据访问的服务器，通过简化Figma API响应，帮助AI更准确地实现设计到代码的一键转换。

Edgeone Pages MCP Server

EdgeOne Pages MCP是一个通过MCP协议快速部署HTML内容到EdgeOne Pages并获取公开URL的服务

Context7 MCP是一个为AI编程助手提供实时、版本特定文档和代码示例的服务，通过Model Context Protocol直接集成到提示中，解决LLM使用过时信息的问题。

Minimax MCP Server

MiniMax Model Context Protocol (MCP) 是一个官方服务器，支持与强大的文本转语音、视频/图像生成API交互，适用于多种客户端工具如Claude Desktop、Cursor等。

Exa MCP Server是一个为AI助手（如Claude）提供网络搜索功能的服务器，通过Exa AI搜索API实现实时、安全的网络信息获取。

百度地图MCP Server是国内首个兼容MCP协议的地图服务，提供地理编码、路线规划等10个标准化API接口，支持Python和Typescript快速接入，赋能智能体实现地图相关功能。

AIbase

智启未来，您的人工智能解决方案智库

简体中文

© 2025AIbase 备案号：闽ICP备08105208号-24