MCP Atomictoolkit

MCP Atomictoolkit

一个兼容MCP协议的服务器项目，通过ASE、pymatgen和机器学习原子间势能（MLIPs）提供原子尺度模拟功能，目前正在积极开发中。

研究与数据开发者工具 #原子模拟 #MCP协议 #机器学习 #结构优化 .Python

评分 : 2.5分

下载量 : 6.1K

更新时间 : 2025-04-29

什么是Atomistic Toolkit MCP Server?

这是一个基于ASE(原子模拟环境)和pymatgen的工具服务器，提供原子级材料模拟功能。它允许用户创建和操作分子结构，进行几何优化，并支持多种文件格式的读写操作。

如何使用Atomistic Toolkit MCP Server?

通过MCP协议与服务器建立连接后，您可以发送结构创建请求、优化指令或文件操作命令。服务器会返回计算结果或处理后的结构数据。

适用场景

适用于材料科学研究、分子动力学模拟、晶体结构分析等领域。特别适合需要原子级精度计算的研究人员。

主要功能

结构创建与操作

支持创建各种分子和晶体结构，并提供原子位置调整、晶格参数修改等功能

几何优化

对分子或晶体结构进行能量最小化计算，找到最稳定的构型

文件I/O操作

支持多种格式的结构文件读写，包括CIF、POSCAR、XYZ等常见格式

优势

集成多种原子模拟工具(ASE, pymatgen)

支持机器学习原子间势(MLIPs)

通过标准MCP协议易于集成

局限性

项目仍在积极开发中，部分功能可能不稳定

需要一定的计算资源支持

对非专业用户学习曲线较陡

如何使用

建立连接

通过MCP协议与服务器建立连接

发送请求

发送结构创建或计算请求

获取结果

接收并处理服务器返回的计算结果

使用案例

创建硅晶体结构

创建一个金刚石结构的硅晶体，并进行几何优化

分子结构优化

对有机分子进行结构优化，寻找最低能量构型

常见问题

这个服务器支持哪些文件格式?

计算需要多长时间?

如何知道哪些功能已经可用?

相关资源

ASE文档

原子模拟环境(ASE)官方文档

pymatgen文档

pymatgen材料分析库文档

MCP协议说明

Model Context Protocol官方说明

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