Chembl MCP Server

🚀 ChEMBL-MCP-Server

这是一个基于 chembl_webresource_client 包的 FastMCP 封装服务器，可提供对 ChEMBL 数据库的 API 访问，为相关数据操作带来便利。

🚀 快速开始

要使用该服务器，你可以按照以下步骤进行安装和启动：

安装

# 克隆仓库
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安装依赖项
pip install -r requirements.txt

启动服务器

# 使用默认配置启动 HTTP 服务器
python chembl_searver.py

# 指定主机和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用 stdio 传输
python chembl_searver.py --transport stdio

# 设置日志级别
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

可用参数

• --host：服务器主机地址，默认为 127.0.0.1
• --port：服务器端口，默认为 8000
• --transport：传输方法，可选 http 或 stdio，默认为 http
• --log-level：日志级别，可选 DEBUG、INFO、WARNING、ERROR、CRITICAL，默认为 INFO

✨ 主要特性

• 对 ChEMBL 数据库进行全面的 API 访问。
• 使用 FastMCP 框架实现异步 API 调用。
• 内置错误处理和超时机制。
• 支持 HTTP 和 stdio 传输方法。
• 具备完整的类型注解和文档字符串。

💻 使用示例

查看 chembl_search.py 文件以了解各种 API 的使用示例。

📚 详细文档

API 功能

该服务器提供了以下 API 功能：

数据实体 APIs

• example_activity：获取活动数据
• example_assay：获取测定数据
• example_target：获取靶点数据
• example_molecule：获取分子数据
• example_drug：获取药物数据
• 更多数据实体 APIs...

化学工具 APIs

• example_canonicalizeSmiles：规范 SMILES 字符串
• example_smiles2inchi：将 SMILES 转换为 InChI
• example_smiles2svg：将 SMILES 转换为 SVG 图像
• example_structuralAlerts：获取结构警戒信息
• 更多化学工具 APIs...

依赖项

📄 许可证

MIT