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Chembl MCP Server
概述
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替代品
什么是ChEMBL-MCP-Server?
ChEMBL-MCP-Server是一个基于FastMCP框架的API服务，它封装了ChEMBL数据库的化学和生物活性数据，为研究人员提供便捷的查询接口。通过这个服务，用户可以轻松获取药物分子、生物靶点、活性测试等关键数据。如何使用ChEMBL-MCP-Server?
您可以通过简单的API调用来访问ChEMBL数据库，无需复杂的配置。服务支持HTTP和标准输入输出两种交互方式，适合不同场景下的集成需求。适用场景
适用于药物发现研究、化学信息学分析、生物活性数据挖掘等场景。研究人员可以通过API快速获取所需化学数据，加速研究进程。主要功能
完整ChEMBL数据访问提供对ChEMBL数据库中所有实体(分子、靶点、活性数据等)的API访问能力
异步API调用基于FastMCP框架实现的高性能异步API，支持并发请求处理
内置错误处理自动化的错误处理和超时机制，确保服务稳定性
多种传输方式支持HTTP和stdio两种传输方式，适应不同集成需求
化学工具API提供SMILES标准化、结构转换等实用化学工具
优势与局限性
优势
简化了ChEMBL数据库的访问流程
高性能的异步API设计
完善的错误处理机制
支持多种传输协议
丰富的化学数据处理工具
局限性
需要网络连接访问ChEMBL数据库
大规模数据查询可能有性能限制
需要基本API调用知识
如何使用
安装服务克隆代码库并安装依赖项
启动服务选择适合的启动方式
调用API通过HTTP客户端或命令行工具调用API接口
使用案例
查询分子活性数据获取特定分子在ChEMBL中的所有生物活性测试结果
SMILES标准化将化学分子SMILES字符串转换为标准形式
获取分子SVG图像将分子结构转换为SVG格式的图像
常见问题
1
需要ChEMBL账号才能使用吗？不需要，服务使用公开的ChEMBL数据接口，无需单独注册账号。
2
查询结果有延迟怎么办？可以尝试增加超时时间，或分批查询大数据集。ChEMBL服务器有时响应较慢。
3
如何获取最新的化学数据？服务会自动连接最新的ChEMBL数据库版本，无需手动更新。
4
支持哪些化学格式转换？支持SMILES、InChI、SVG等多种化学格式的相互转换。
相关资源
ChEMBL官方网站ChEMBL数据库的官方网站
GitHub代码库项目源代码和最新更新
FastMCP框架文档底层框架的技术文档
化学信息学教程化学信息学入门教程
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