🚀 🧠 OSDR MCP 服务器与代理

本项目展示了如何将 MCP 代理集成到自定义工具中，从而实现与 NASA 的开放科学数据存储库（OSDR）的交互。项目还包含使用 Model Context Protocol (MCP) 工作流对生物数据进行分析和总结的示例代理，为相关领域的数据处理提供了实用的解决方案。

📦 包含内容

osdr_mcp/

这是一个自定义的 MCP 服务器，提供了与 OSDR 数据交互的实用工具：

• osdr_fetch_metadata：可获取给定 OSDR 数据集的元数据。
• osdr_find_by_organism：能按生物体对研究进行过滤。
• 其他工具（例如 RNA 分析）存于 osdr_viz_tools 中。

first_example/

这是一个简单的代理，使用了两个官方 MCP 服务器：

• mcp-server-fetch（无头浏览器）
• mcp-server-filesystem

该代理会收集信息并生成一条推文大小的摘要。

second_example/

此示例与 first_example 类似，但连接到 osdr_mcp/main_simple.py 定义的自定义 MCP 服务器。它演示了如何集成特定领域的工具，例如 OSDR 元数据检索器。

third_example/

这是一个完整的多代理工作流：

1. 获取代理：抓取 OSD 研究元数据。
2. 定量分析代理：下载 RNA 计数数据并创建条形图。
3. 摘要编写器代理：生成包含分析总结的 Markdown 报告。

此工作流使用了自定义 MCP 服务器：

• osdr_data_fetch
• osdr_viz_tools

⚙️ 配置

cp_agent.config.yaml 文件可控制以下内容：

• LLM 后端（例如 Ollama、OpenAI）
• MCP 服务器连接
• 工具可用性
• 系统提示 / 元数据

🚀 快速开始

克隆仓库并安装依赖

1. 克隆此仓库。
2. 安装依赖项：

   pip install -r requirements.txt
   

运行示例或启动服务器

运行示例

python first_example/main.py

直接启动 MCP 服务器

python osdr_mcp/main_simple.py

🧩 集成说明

本架构具有高度的灵活性，您可以根据实际需求在文档问答、RAG 搜索或自定义分析工具之间进行切换。对于用户界面集成，建议使用模式开关或 UI 切换。基于 Milvus 的 RAG 支持正在开发中。

📚 资源

• Model Context Protocol
• NASA OSDR API