DICOM MCP 服务器

简介

DICOM MCP 服务器是一个基于 Model Context Protocol (MCP) 的工具，用于与 DICOM 标准兼容的医学影像系统进行交互。它支持通过 MCP 协议检索和操作 DICOM 数据，并提供了一些实用功能，例如从封装在 DICOM 实例中的 PDF 文档中提取文本。

安装

使用 pip 安装

pip install dicom-mcp

从源码安装

1. 克隆仓库：

   git clone https://github.com/yourusername/dicom-mcp.git
   cd dicom-mcp
   

2. 创建虚拟环境并激活：

   python -m venv .venv
   source .venv/bin/activate  # 在 Windows 上使用：.venv\Scripts\activate
   

3. 安装依赖：

   pip install -e .
   

快速上手

启动服务器

uvicorn dicom_mcp.server:app --reload

使用配置文件启动

创建一个配置文件 config.yaml：

DICOM:
  AE_Title: My DICOM Server
  Port: 11112
  Max_Workers: 4
  LogLevel: INFO
  Query_Retrieve_Capability:
    SCP: true
    SCU: false
  Storage_SCP: true
  Query_SCP: true
  Retrieve_SCP: true

然后启动服务器：

uvicorn dicom_mcp.server:app --reload --config config.yaml

功能概述

检索 DICOM 数据

搜索患者

patients = client.search_patients()
for patient in patients:
    print(f"Patient ID: {patient.PatientID}, Name: {patient.Name}")

搜索研究

studies = client.search_studies(patient_id="12345")
for study in studies:
    print(f"Study Instance UID: {study.StudyInstanceUID}, Modality: {study.Modality}")

搜索系列

series = client.search_series(study_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.1.1")
for series in studies:
    print(f"Series Instance UID: {series.SeriesInstanceUID}, Description: {series.SeriesDescription}")

搜索实例

instances = client.search_instances(series_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.1.2")
for instance in instances:
    print(f"SOP Instance UID: {instance.SOPInstanceUID}")

检索特定实例

instance = client.retrieve_instance(
    study_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.1.1",
    series_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.1.2",
    sop_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2.1.3"
)
print(instance.PixelData)

封装 PDF 文本提取

text = client.extract_pdf_text(
    study_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.104.1.1",
    series_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.104.1.2",
    sop_instance_uid="1.2.840.10008.5.1.4.1.1.104.1.3"
)
print(text)

配置

默认配置文件

DICOM:
  AE_Title: My DICOM Server
  Port: 11112
  Max_Workers: 4
  LogLevel: INFO
  Query_Retrieve_Capability:
    SCP: true
    SCU: false
  Storage_SCP: true
  Query_SCP: true
  Retrieve_SCP: true

自定义配置

创建一个自定义配置文件 config.yaml：

DICOM:
  AE_Title: My Custom DICOM Server
  Port: 11113
  Max_Workers: 8
  LogLevel: DEBUG
  Query_Retrieve_Capability:
    SCP: false
    SCU: true
  Storage_SCP: false
  Query_SCP: false
  Retrieve_SCP: true

然后启动服务器：

uvicorn dicom_mcp.server:app --reload --config config.yaml

开发

克隆仓库

git clone https://github.com/yourusername/dicom-mcp.git
cd dicom-mcp

安装依赖

pip install -r requirements.txt

启动开发服务器

uvicorn dicom_mcp.server:app --reload

贡献

1. Fork 仓库。
2. 创建功能分支。
3. 提交更改。
4. 推送到分支。
5. 创建拉取请求。

许可证

本项目使用 MIT 许可证。