Chembl MCP Server

🚀 ChEMBL-MCP-Server

ChEMBL-MCP-Server是一个基于chembl_webresource_client包的快速MCP包装服务器，可提供对ChEMBL数据库的API访问，为用户操作ChEMBL数据库带来便利。

🚀 快速开始

ChEMBL-MCP-Server的使用非常便捷，按照以下步骤操作即可：

# 克隆仓库
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt

✨ 主要特性

• 提供完整的ChEMBL数据库API访问，满足多样化的数据需求。
• 运用FastMCP框架实现异步API调用，提升访问效率。
• 内置错误处理和超时机制，保障服务的稳定性。
• 支持HTTP和stdio传输方法，方便不同场景使用。
• 提供完整的类型注解和文档字符串，便于开发者理解和使用。

📦 安装指南

# 克隆仓库
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt

💻 使用示例

基础用法

启动服务器有多种方式，以下是一些常见的启动命令：

# 使用默认配置启动HTTP服务器
python chembl_searver.py

# 指定主机和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用stdio传输
python chembl_searver.py --transport stdio

# 设置日志级别
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

可用参数说明

📚 详细文档

API功能

该服务器提供了丰富的API功能，主要分为数据实体API和化学工具API：

数据实体API

• example_activity：获取活性数据
• example_assay：获取测定数据
• example_target：获取靶点数据
• example_molecule：获取分子数据
• example_drug：获取药物数据
• 更多数据实体API...

化学工具API

• example_canonicalizeSmiles：规范SMILES字符串
• example_smiles2inchi：将SMILES转换为InChI
• example_smiles2svg：将SMILES转换为SVG图像
• example_structuralAlerts：获取结构警戒信息
• 更多化学工具API...

示例

若需查看使用各种API的示例，请查看chembl_search.py文件。

🔧 技术细节

依赖项

本项目依赖以下库：

• chembl_webresource_client：ChEMBL网络服务客户端
• mcp：MCP框架
• fastapi：FastAPI框架
• uvicorn：ASGI服务器
• asyncio：异步I/O库

📄 许可证

本项目采用MIT许可证。