简单的PubMed MCP 服务器

一个通过Entrez API提供对PubMed文章访问的MCP服务器。

特性

• 使用关键词搜索PubMed数据库
• 访问文章摘要
• 下载全文（当文章在PubMed上开放获取时）

请注意，工具返回的是XML格式的全文。这对于AI来说更有用，因为它提供了文档结构的额外信息。至少，这是Claude 3.5 Sonnet所偏好的。

此外，请注意，该工具和其他工具可能无法提供论文全文并不一定意味着论文不可用。在测试该工具时，我遇到了一篇没有全文在PubMed上的论文，但Claude通过DOI访问出版URL时得到了“禁止”错误。然而，我能够使用常规浏览器访问同一页面。

简而言之，如果你的AI助手无法通过此工具获得论文全文，请尝试手动使用常规浏览器访问。

最后，该工具当然无法提供对付费期刊文章的访问。你可能需要通过你的图书馆资源或——作为最后手段——通过一个旨在使公开资助的研究免费提供的网站来阅读它们。

安装

通过Smithery安装

要自动通过Smithery安装Simple PubMed for Claude Desktop：

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

手动安装

pip install mcp-simple-pubmed

配置

服务器需要以下环境变量：

• PUBMED_EMAIL：你的电子邮件地址（NCBI要求）
• PUBMED_API_KEY：可选的API密钥，用于更高的速率限制

标准速率为3请求/秒。未实施速率限制，因为通常情况下不太可能AI生成的流量超过此限制。如果你需要，可以注册一个API密钥以获得10请求/秒的速率。阅读NCBI页面上的相关内容。

与Claude Desktop一起使用

将以下内容添加到你的Claude Desktop配置文件（claude_desktop_config.json）中：

（Mac OS）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

（Windows）

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

许可证

MIT License